Prinses Isabella is geboren op 21 april 2007 in Kopenhagen als dochter van kroonprins Frederik en kroonprinses Mary van Denemarken. Ze heeft twee broers, prins Christian (2005) en prins Vincent (2011), en een zus, prinses Josephine (2011). 

Isabella is gedoopt op 1 juli 2007 in de paleiskapel van Fredensborg Slot. Haar peetouders zijn onder anderen koningin Mathilde van België en prinses Alexia van Griekenland en Denemarken (een nicht van haar vader).

Prinses Isabella is derde in de lijn van troonopvolging.